El Doctorado en Ciencias Económicas está orientado a la formación de profesores e investigadores de alto nivel académico. Su orientación hacia la investigación innovadora en los aspectos más relevantes del desarrollo económico regional, aunada a la interacción con grupos de investigación de alto rendimiento en instituciones académicas del país y el extranjero, permitirá avanzar en el fortalecimiento de la identidad institucional en relación con su entorno estatal, regional y fronterizo. En consecuencia, las interacciones con los sectores productivos, gubernamentales y no gubernamentales involucrados en la actividad industrial, de explotación de los recursos naturales, de planeación del desarrollo regional y de generación de opciones para combatir la pobreza, le dan al programa una fuerte orientación hacia la economía aplicada, sustentada en bases teóricas de la frontera.